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北京大学生物信息资源系统提供数据和软件服务
http://www.edu.cn   2012-11-18 中国教育网络 作者:罗静初

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  面对如此浩瀚的数据海洋,传统的生物学研究模式已经不能适应,必须借助于生物信息技术和生物信息学手段。生物信息技术所要处理的对象是数据,生物信息学所要研究的对象也是数据,即从大量数据中提取信息,从大量信息中获取知识,将大量知识转化为技术,将大量知识上升为理论。“数据-信息-知识-技术”,是生物信息技术开发的基本过程;“数据-信息-知识-理论”,是生物信息学研究的基本模式。十多年来,生物信息学已逐步成为一门独立学科,同时生物信息软件开发也形成了一个专门领域。它以核酸、蛋白质等生物大分子数据为主要对象,以数理科学、信息科学和计算机科学为主要手段,以计算机网络为主要研究环境,以计算机软件为主要研究工具,构建各种类型的专用、专门、专业数据库,研究开发面向生物学家的新一代计算机软件,对海量原始数据进行存储、管理、注释、加工,使之成为具有明确生物意义的生物信息,并通过对生物信息的查询、搜索、比较、分析,从中获取基因编码、基因调控、核酸和蛋白质结构功能及其相互关系等理性知识。在大量信息和知识的基础上,探索生命起源、生物进化,以及细胞、器官和个体的发生、发育、病变、衰亡等生命科学中的重大问题,搞清它们的基本规律和时空联系,建立“生物学周期表”。

  生物信息学的理论与工具对生命科学的研究、实验乃至应用有着重要的指导作用,可以显著地提高研究与开发的效率;集成生物信息科学资源与信息,是生命科学研究、生物技术发展的基本前提,全面推动爆炸性增长的生物信息科学数据与信息资源的整合,加速资源利用,已经成为生命科学、生物技术得以快速发展和发生革命性变化的关键因素与必由之路,必将会产生巨大的社会和经济效益。

  因此,随着国际、国内新的高通量生物技术的不断涌现,以及我国在生命科学和生物技术研发上的高投入,我国生命科学研究进入了一个前所未有的快速发展阶段,大大推动了生物信息技术和生物学数据资源共享平台建设在国内的发展和进步。国家设立的每一个重大的生命科学研究项目,无一例外都要包含生物信息技术作为其项目重要组成部分。

  生物信息学为生命科学提供非常重要的支撑作用,生物信息学的结果与发现为生命科学提供了大量可验证的假说,对很多实验有指导作用,并且已有大量事例证明使用生物信息学研究方法可以显著缩短生命科学的研究时间。

  提供生物信息服务

  北京大学生物信息中心成立于1997年,是欧洲分子生物学网络组织(EMBNet)中国节点。“九五”期间主持863生物信息课题。“十五”期间主持并与中国科学院上海生物信息中心、华大基因组研究中心共同承担863“国家生物信息基地建设”项目。2001年以来,分别主持863、973、NSFC、教育部、科技部、北京市科委等10多个科研项目。北京大学生物信息中心在863“国家生物信息学基地”等项目支持下,已成为国内最大的公共生物信息学资源网站,是欧洲生物信息学研究所指定的国际核酸序列数据库EMBL官方发布网站。目前,北京大学生物信息中心FTP服务器上数据已逾6T,包含数10个生物数据库、多个生物信息学软件包及相关课件,以提供完善、高效,并与国际同步更新的公共生物信息学数据资

  源供国内外用户免费下载,月平均流量超过150GB。多年来,为国内外用户提供数据库检索服务,月点击数最高达25万次。中心现有30多台高性能计算机和总容量超过100T 的高性能存储阵列。

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