研究方向四：疾病相关基因组学研究

　　1、中国不同人群永生细胞库的建立 完成柯尔克孜族、傣族、维吾尔族和基诺族永生细胞系库建立和保存。每个人群保存30～50株。

　　2、基因组多样性及疾病相关基因组学研究

　　（1）采用PCR、PCR-RFLP等技术检测东北地区8－10个人群中ApoE、MTHFR、CCR5、CCR2、SDF1等基因多态性位点的频率，利用生物信息学技术、SPSS或SAS统计学软件分析这些基因遗传多态性在中国不同人群中的分布特征，分析这些基因多态性在不同人群中是否存在选择性压力，同时检测这些基因在不同疾病对照组人群中的频率，并对所获得的数据进行关联分析，以阐明这些基因在疾病发生中的可能的作用。

　　（2）采用DNA-Pool DHPLC和Sequencing的方法，结合生物信息学技术，筛查ApoE、LPL 等脂类代谢相关基因和ADH基因在中国人群中的SNPs。采用PCR-RFLP、PCR-Sequencing等技术分析上述各种基因的SNPs在中国不同人群中的分布频率，利用HAPLO软件包分析不同基因由SNPs构成的单体型的组成及频率。利用LINKD软件包分析各个基因两两SNPs间的连锁不平衡，并计算标准连锁不平衡系数D'，确定各个基因的LD block结构及其htSNPs单体型的构成，同时利用Arleiquin软件包分析各人群间的遗传学关系（包括AMOVA分析、pairwise FST等），阐明这些基因在中国不同人群的基本遗传结构特征，为开展常见重大疾病发病相关关系的关联研究奠定基础。

　　3、人类恶性肿瘤恶性增殖的调控机制研究 通过检测不同恶性程度、不同转移能力的肺癌组织及细胞系中TGF-β、TGF-β受体及Smad家族基因在mRNA和蛋白质水平的表达差异，探讨TGF-β信号传导通路与肿瘤发生及转移的关系。

　　采用mRNA指纹图谱法、基因芯片和蛋白质双向电泳等方法，采用生物信息学技术，分析P53基因在转移能力不同的肺癌细胞系中表达差异的情况，探讨p53基因致细胞凋亡通路的改变及其与恶性肿瘤转移发生的关系。

　　4、人类恶性肿瘤抗药机制的研究 双微体（DMs）是肿瘤细胞中基因扩增的主要细胞遗传学标记，也是研究恶性肿瘤抗药性形成机制的主要研究体系。应用抗代谢药物氨甲蝶呤（MTX）体外诱导小鼠胚胎成纤维细胞3T3R500产生抗药性，作为研究基因扩增及细胞耐药机制的模式系统，研究提高抗肿瘤药物作用的有效性。同时，采用染色体显微切割技术分离抗性细胞中的DMs，应用荧光原位杂交（FISH）技术鉴定DMs的染色体起源；建立DMs特异性的DNA文库，经文库筛选、序列测定及生物信息学分析，分析DMs中扩增子的DNA组成，揭示肿瘤细胞抗药性形成的分子基础，探讨细胞的耐药机制。

　　采用染色体显微切割技术分离卵巢癌细胞UACC-1598中自发存在的DMs，应用微FISH技术鉴定DMs的染色体起源，同时使用微克隆技术鉴定DMs的DNA组成，以发现、分离与肿瘤发生、演进有关的相关基因，为明确卵巢癌发生的遗传学背景奠定分子基础。

　　5、人类恶性肿瘤相关基因的克隆、功能及肿瘤抗药机制的研究 通过基因扫描分析，进行更精细的染色体区域定位，采用基因表达差异分析的方法，进行肺癌转移相关基因的克隆、表达载体的构建和蛋白质的功能研究，确定其与肺癌转移的关系及其可能具有的分子生物学功能。并采用微卫星基因组扫描和基因芯片技术，在CGH分析所定位染色体区域中进行胃癌发生相关基因的定位与初步的功能研究。

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