马铃薯Y病毒属病毒编码的辅助成分-蛋白酶（helper component-proteinase，HC-Pro）是第一个被鉴定的RNA沉默抑制因子。本研究利用农杆菌共浸润的方法分析了马铃薯A病毒（PVA）HC-Pro三个位点氨基酸的突变对抑制RNA沉默活性的影响。结果显示，Phe6、Asn11的缺失降低了PVA HC-Pro抑制RNA沉默活性，IGN基序中的Ile250和Gly251分别突变为Asp和Glu 使HC-Pro完全丧失了抑制RNA沉默活性。荧光的强弱与绿色荧光蛋白的表达量和GFP mRNA的量正相关，而与GFP siRNA的积累量呈负相关。这些结果表明IGN对于PVA HC-Pro抑制RNA沉默是必需的，HC-Pro调控基因组复制和抑制RNA沉默的功能域部分重合；保守氨基酸Phe7和糖基化位点Asn12对于抑制RNA沉默活性不是必需的，但可以调控PVA HC-Pro抑制RNA沉默活性的强弱。