日本文部科学省消息称，2013年10月京都大学基础物理学研究所和筑波大学科学研究中心的超级计算机，曾被黑客入侵。在这两所大学里的超级计算机里保存着800名研究者在最尖端的粒子物理学和宇宙物理学等研究上的数据。黑客可能已经将这些数据盗走或者消除这些数据。两所大学称他们是在事件发生一个月后发现的，当时马上停止了超级电脑的操作。日文部科学省就此事件发表意见说，要求两所大学彻底确保安全措施。