郭爱克的导师斯穆拉建议他攻读博士学位，其时中国尚无博士制度。他对郭爱克说：“也许现在的中国还不需要博士，但是将来肯定需要。在西方，如果你是一位科学家，但没有博士学位，人们是不太理解的。”导师斯穆拉不厌其烦，为郭爱克办理了大学毕业证书公证等手续，确认郭爱克在莫斯科大学的学历与德国学历等价。这些给了郭爱克最大的支持，他下定决心：“我的目标不是拿博士学位，但一定要在两年中做出博士水平的工作来。”

　　1979年9月20日，郭爱克用了两年时间，以“特优”的总成绩获得了慕尼黑大学博士学位。德国科学技术交流中心负责与中国学术交流事务的伯兰特·多恩女士，在郭爱克博士论文答辩前夕，给他的一封祝贺函中写道：“这将是二战以后，来自中华人民共和国的科学工作者在联邦德国获得的第一个博士学位。”

　　1978年，德国马普学会生物控制论研究所所长赖夏特教授郑重向郭爱克作了解释：“上次我没有接受你，这只是一个推迟，为此我需要特别向你说明。我希望你能够来我这里工作。”

　　1982年11月至1984年6月，郭爱克作为访问学者，来到了德国马普学会生物控制论研究所，从事家蝇视觉系统“图形与背景”分辨的生物控制论研究。

　　到53岁才开始迷上果蝇

　　1992年，回国十年之后，成为郭爱克科研人生坐标系上的又一个重要转折。北京召开了第19届世界昆虫学大会。分组会上，德国乌尔茨堡大学海森堡教授的同事蓝哈特博士作了果蝇视觉学习、记忆的研究报告，这项研究工作在飞行模拟器上完成。听了这个报告，郭爱克兴奋极了，立刻提出向海森堡教授学习和合作的请求，并得到了海森堡教授的积极回应。

　　1993年年末，郭爱克第三次赴德国，先后去了乌尔茨堡大学以及马普学会生物控制论研究所。这时郭爱克已经53岁，许多人不理解，已经这么大年纪了，还去做一个全新的领域，能有多大突破呢？郭爱克看得很明白：“第一我有基础，‘果蝇’与我之前做的东西有关联。第二我觉得很有趣，为什么这么小的虫子能有学习的能力？”

　　基础+兴趣+执著，成为53岁的郭爱克敢于“另起炉灶”，开创新天地的不竭动力。

　　在海森堡实验室三个月的实验结果，郭爱克发现，果蝇学习记忆和营养条件及果蝇的日龄都有关系，“这是一个有趣的发现”。此后，郭爱克分别与海森堡教授、盖茨教授合作，在国际著名杂志《学习与记忆》上发表了两篇研究论文。

　　在德国，郭爱克收获的不仅仅是学术上的成功，更令他感动的是德国科学家的友情。

　　1993年12月24日。圣诞节前夜，郭爱克还一个人在海森堡实验室里工作。他一不小心，把仪器中一个比头发丝还细的旋丝给弄断了。为了不影响实验进度，他不得已给德国朋友高级工程师蓝哈特打电话。圣诞节的前半天，这位德国工程师赶回实验室，一边修理，一边给他讲解工作原理。

　　在对郭爱克绝对保密的情况下，马普学会生物控制论研究所由盖茨教授指导，为郭爱克加工了他最需要的实验系统的主要部件。在郭爱克即将离开回国之际，盖茨教授和车间的那些工人师傅们给了他一个巨大的惊喜，这让他感动得流泪。是呀，仪器设备对科学家多么重要，而这又是有钱也买不到的实验系统啊！

　　1993年，乌尔茨堡大学的蓝哈特来到北京，将这套仪器改装成研究果蝇视觉学习、记忆的系统。正是有了这套实验系统，郭爱克才能够在中科院生物物理研究所建立了自己的“果蝇学习记忆实验室”，这也是中国第一个以果蝇视觉操作条件化为评价范式的实验室。

　　自此，郭爱克开始走近果蝇的维妙的“认知世界”。