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CERNET第24届学术年会
选择字体:    中山大学    发布时间:2011-12-08

中山大学余新炳完成雌雄同体寄生吸虫测序图

  国家973计划项目、三期985仪器平台等支持下,中山大学中山医学院余新炳教授领衔的课题组应用新一代Illumina高通量测序技术完成单条肝吸虫全基因组测序工作,并通过序列组装绘制出了肝吸虫基因组精细图谱,所测基因组大小为550,293,470bp,scaffoldN50值达到420,191bp,超过了国际标准的300Kb。重复序列占34%,GC含量为43%。同时,该课题组通过计算机预测、同源比对预测和转录组注释等方法整合,预测了13,680个蛋白编码基因,经过基因功能注释,获得了许多与能量代谢、与致胆管癌相关的基因以及分泌蛋白基因,这对了解肝吸虫致病的分子机制有深刻意义。

  背景:肝吸虫病是我国目前最重要的食源性寄生虫病,2005年被卫生部列为重点防治的寄生虫病,同时也是广东省重点防治的三大地方病之一,流行病学调查估计广东省拥有感染者达500多万。肝纤维化和肝硬化是肝吸虫病最严重的危害之一,其发病机制和干预措施是肝吸虫病防治的难点和重点,防治肝吸虫病对快速诊断、生态疫苗研发、传染源控制等方面提出了重要的需求。

肝吸虫基因的功能分类图(a)和肝吸虫蛋白结构域特异性与其他物种比较图(b)

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