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基于角度离散化的基因调控网络定性分析
2010-04-12 中国科技论文在线 刘庆峰

  基因调控网络的分析有一个假设,即时间序列表达值变化趋势相似的两个基因可能存在调控关系。因此,对基因表达数据进行角度离散化,可以反映出基因表达值的变化趋势和程度,从而定性分析基因间的调控关系。计算基因时间序列表达值中相邻两点连线的水平夹角,使基因表达数据角度化。然后,比较角度化后每个行向量中相邻角度的大小,依据角度离散化规则,将基因表达数据离散为6种状态。离散化后的6种状态不仅反映了基因表达值的变化趋势,还反映了变化程度。通过作差和相关频率方法辨别出存在调控关系的基因。

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