| 序号 | 名 称 | 建立时间 | 批准部门 | 负责人 | 备注 |
| 1 | 内蒙古自治区高校资源与环境信息系统重点（开放）实验室 | 2002 | 教育厅 | 包玉海 | |
| 2 | 内蒙古自治区遥感与地理信息系统重点实验室 | 2003 | 科技厅 | 包玉海 | |
| 3 | 内蒙古自治区高校心理教育研究中心 | 2007 | 教育厅 | 杨伊生 | |
| 4 | 内蒙古自治区高校民族学重点研究基地 | 2007 | 教育厅 | 乌日陶克套胡 | |
| 5 | 内蒙古自治区功能材料物理与化学重点实验室 | 2007 | 科技厅 | 特古斯 | |
| 6 | 内蒙古自治区心理学重点实验室 | 2007 | 科技厅 | 陈中永 | |
| 7 | 内蒙古民俗文化研究基地 | 2008 | 自治区党委宣传部 | 杨一江 | |
| 8 | 内蒙古自治区高校中国北疆史研究基地 | 2009 | 教育厅 | 于 永 | |
| 9 | 内蒙古自治区高校思想政治教育理论与实践研究基地 | 2009 | 教育厅 | 陈 江 | |
| 10 | 内蒙古自治区高校民族工业产品设计研究重点实验室 | 2009 | 教育厅 | 苏 和 | |
| 11 | 生物多样性保护与可持续利用重点实验室 | 2009 | 教育厅 | 哈斯巴根 | 高校重点实验室培育基地 |
| 12 | 内蒙古自治区工业产品设计研究重点实验室 | 2010 | 科技厅 | 苏 和 |
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