1、 国家教育部CERNET领导小组（State Education Commission CERNET Leading Group）
由国家教委有关领导组成，是CERNET的最高领导和决策机构。

2、CERNET管理委员会（CERNET Administration Committee）
由国家教委有关领导和十所高校主管校长组成，负责领导并对重大问题进行决策。

3、CERNET专家委员会（ CERNET Expert Committee）
由十所高校的有关专家组成，全面负责总体规划和设计等技术工作。

4、CERNET全国网络中心（CERNET National Network Center）
设在清华大学，负责全国主干网的运行管理，信息资源服务等。

5、地区网络中心和主结点（ Regional Network Centers and Main Nodes）
地区网络中心和地区主结点分别设在十所高校，负责地区网络中心的运行管理以及地区网络规划和建设。