第四军医大学预防医学系郭国祯教授等人采用辐射生物学效应原理，应用Mprobe软件设计探针筛选参与辐射生物学效应基因，日前成功研制出一款由143个基因组成的电离辐射相关低密度寡核苷酸基因芯片。该芯片为检测不同辐射敏感性肿瘤细胞的差异表达基因提供了一个新的技术平台。
基因芯片作为一门新兴技术，其具有高通量、微型化和自动化等特点，被广泛用于各种组织的表达谱分析。近年来，它主要在电离辐射领域用于检测辐射诱导的相关基因。但由于高密度芯片针对性不强等原因而影响了该技术的研究和发展。
为研制一种用于放射领域研究的基因芯片，郭万锋等人选择了与辐射效应相关的人类细胞凋亡基因、细胞周期基因及DNA损伤修复基因等作为候选基因，通过对寡核苷酸的合成、肺腺细胞（A549）和肺小细胞癌细胞（NCI-H446）的培养、基因芯片的杂交、洗涤以及对差异表达基因的检测等技术手段处理后，成功地研制出这款辐射相关低密度寡核苷酸基因芯片。
研究人员采用RT-PCR检测发现该基因芯片共含有基因143个，其中辐射相关基因127个，对照基因16个；芯片杂交中出现286个杂交点，平均每个基因两个；在不同辐射敏感性的A549和NCI-H446细胞中，研究人员筛选出18个差异表达基因，经检测与芯片结果一致，具有较好的可信度。该结果提示低密度寡核苷酸基因芯片有较好的敏感性、特异性和重复性，可检测不同辐射敏感性肿瘤细胞的差异表达基因。
据郭国祯介绍，基因芯片技术的应用虽然越来越广泛，但目前国内仍然还没有一种适用于放射研究领域的基因芯片。现有的高密度芯片，存在针对性不强、实验资料繁杂、不利分析运作和耗费高等问题。因此，此次研制的辐射低密度寡核苷酸基因芯片去掉了众多的干扰因素，有利于生物信息学分析，可筛选出不同辐射敏感性肿瘤细胞的差异基因，对于从分子水平理解肿瘤细胞的辐射抗性具有重要作用，该芯片也提供了放射研究领域的一个崭新技术平台。
2006-04-26