生命有机化学国家重点实验室于1988年由国家计委批准筹建,1989年开始建设,并于1990年9月经中国科学院批准边建设边开放,1991年12月建成并通过国家验收。
马大为研究员为现任室主任,俞飚研究员为副主任。吴毓林研究员为第一任室主任,吴厚铭研究员为第二任室主任。中国科学院院士黄维垣研究员任第一届学术委员会主任,惠永正研究员任第二,三届学术委员会主任;第三届学术委员会由15位国内有机化学和生物学界著名科学家组成组成。实验室现有固定人员40人( 15 名具有高级职称),其中研究人员36人( 包括博士生导师 11人),技术管理人员等4人( 主要承担大中型仪器的维护和测试工作)。